Wenn man einen .NET-Dienst auf einem 64bi6t-Server als 32bit laufen lassen muss, kann man die Exe-Datei mit dem Tool corflags (mit Visual Studio dabei) einsetzen:

corflags /32bit+ myservice.exe

http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms164699%28v=vs.80%29.aspx